Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFP01375 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFP01375 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFP01375 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFP01375 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFP01375 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFP01375 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFP01375 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFP01375 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFP01375 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFP01375 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFP01375 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFP01375 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFP01375 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFP01375 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFP01375 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFP01375 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFP01375 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFP01375 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFP01375 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFP01375 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFP01375 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFP01375 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFP01375 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFP01375 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFP01375 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFP01375 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFP01375 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFP01375 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFP01375 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFP01375 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFP01375 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFP01375 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFP01375 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFP01375 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFP01375 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFP01375 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFP01375 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFP01375 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFP01375 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFP01375 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFP01375 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFP01375 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFP01375 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFP01375 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFP01375 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFP01375 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFP01375 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFP01375 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFP01375 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFP01375 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFP01375 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFP01375 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFP01375 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFP01375 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFP01375 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFP01375 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFP01375 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFP01375 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFP01375 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFP01375 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFP01375 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFP01375 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFP01375 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFP01375 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFP01375 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFP01375 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFP01375 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFP01375 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFP01375 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFP01375 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFP01375 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFP01375 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFP01375 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFP01375 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFP01375 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFP01375 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFP01375 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFP01375 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFP01375 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFP01375 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFP01375 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFP01375 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFP01375 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFP01375 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFP01375 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFP01375 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFP01375 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFP01375 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFP01375 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFP01375 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFP01375 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFP01375 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFP01375 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFP01375 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFP01375 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFP01375 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFP01375 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFP01375 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFP01375 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms