Protein–RNA interactions for Protein: P01116

KRAS, GTPase KRas, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRASP01116 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRASP01116 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRASP01116 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRASP01116 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRASP01116 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRASP01116 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRASP01116 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRASP01116 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KRASP01116 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRASP01116 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRASP01116 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRASP01116 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRASP01116 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRASP01116 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRASP01116 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRASP01116 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRASP01116 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRASP01116 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRASP01116 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRASP01116 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRASP01116 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRASP01116 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRASP01116 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRASP01116 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRASP01116 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRASP01116 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRASP01116 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRASP01116 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRASP01116 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRASP01116 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRASP01116 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRASP01116 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRASP01116 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRASP01116 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRASP01116 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRASP01116 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRASP01116 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRASP01116 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRASP01116 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRASP01116 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRASP01116 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
KRASP01116 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KRASP01116 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRASP01116 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRASP01116 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRASP01116 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRASP01116 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRASP01116 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRASP01116 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRASP01116 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRASP01116 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRASP01116 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRASP01116 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRASP01116 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRASP01116 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRASP01116 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRASP01116 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRASP01116 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRASP01116 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRASP01116 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRASP01116 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRASP01116 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRASP01116 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRASP01116 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRASP01116 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRASP01116 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRASP01116 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRASP01116 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms