Protein–RNA interactions for Protein: P00441

SOD1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD1P00441 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOD1P00441 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOD1P00441 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOD1P00441 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOD1P00441 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOD1P00441 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOD1P00441 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOD1P00441 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOD1P00441 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOD1P00441 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOD1P00441 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOD1P00441 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOD1P00441 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOD1P00441 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOD1P00441 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOD1P00441 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOD1P00441 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOD1P00441 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOD1P00441 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD1P00441 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD1P00441 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD1P00441 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD1P00441 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD1P00441 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD1P00441 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD1P00441 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD1P00441 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD1P00441 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD1P00441 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD1P00441 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD1P00441 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOD1P00441 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD1P00441 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD1P00441 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD1P00441 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD1P00441 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD1P00441 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD1P00441 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD1P00441 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD1P00441 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD1P00441 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD1P00441 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOD1P00441 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOD1P00441 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOD1P00441 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOD1P00441 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOD1P00441 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOD1P00441 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOD1P00441 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOD1P00441 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOD1P00441 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOD1P00441 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOD1P00441 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD1P00441 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD1P00441 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD1P00441 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD1P00441 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD1P00441 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD1P00441 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD1P00441 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD1P00441 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD1P00441 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD1P00441 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD1P00441 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD1P00441 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOD1P00441 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOD1P00441 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOD1P00441 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOD1P00441 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOD1P00441 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD1P00441 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD1P00441 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD1P00441 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD1P00441 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD1P00441 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOD1P00441 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOD1P00441 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOD1P00441 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOD1P00441 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOD1P00441 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOD1P00441 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOD1P00441 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOD1P00441 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOD1P00441 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOD1P00441 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOD1P00441 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOD1P00441 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOD1P00441 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOD1P00441 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOD1P00441 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOD1P00441 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOD1P00441 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOD1P00441 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOD1P00441 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOD1P00441 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOD1P00441 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOD1P00441 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOD1P00441 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOD1P00441 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOD1P00441 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms