Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYF2O95926 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYF2O95926 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYF2O95926 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYF2O95926 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYF2O95926 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYF2O95926 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYF2O95926 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYF2O95926 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYF2O95926 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYF2O95926 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYF2O95926 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYF2O95926 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYF2O95926 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYF2O95926 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYF2O95926 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYF2O95926 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYF2O95926 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYF2O95926 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYF2O95926 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYF2O95926 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYF2O95926 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYF2O95926 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYF2O95926 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYF2O95926 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYF2O95926 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYF2O95926 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYF2O95926 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYF2O95926 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYF2O95926 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYF2O95926 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYF2O95926 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYF2O95926 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYF2O95926 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYF2O95926 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYF2O95926 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYF2O95926 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYF2O95926 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYF2O95926 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYF2O95926 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYF2O95926 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYF2O95926 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYF2O95926 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYF2O95926 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYF2O95926 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYF2O95926 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYF2O95926 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYF2O95926 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYF2O95926 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYF2O95926 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYF2O95926 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYF2O95926 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYF2O95926 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYF2O95926 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYF2O95926 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYF2O95926 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYF2O95926 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYF2O95926 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYF2O95926 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYF2O95926 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYF2O95926 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYF2O95926 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYF2O95926 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYF2O95926 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYF2O95926 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYF2O95926 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYF2O95926 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYF2O95926 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYF2O95926 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYF2O95926 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYF2O95926 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYF2O95926 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYF2O95926 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYF2O95926 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYF2O95926 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYF2O95926 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYF2O95926 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYF2O95926 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYF2O95926 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYF2O95926 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYF2O95926 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYF2O95926 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYF2O95926 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYF2O95926 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYF2O95926 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms