Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDH8O95206 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH8O95206 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms