Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM13AO94988 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM13AO94988 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM13AO94988 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms