Protein–RNA interactions for Protein: O76071

CIAO1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIAO1O76071 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CIAO1O76071 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CIAO1O76071 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CIAO1O76071 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms