Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCTN3O75935 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms