Protein–RNA interactions for Protein: O75674

TOM1L1, TOM1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L1O75674 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TOM1L1O75674 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TOM1L1O75674 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOM1L1O75674 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms