Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRCPO75575 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRCPO75575 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRCPO75575 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRCPO75575 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRCPO75575 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRCPO75575 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRCPO75575 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRCPO75575 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRCPO75575 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRCPO75575 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRCPO75575 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRCPO75575 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRCPO75575 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRCPO75575 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRCPO75575 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRCPO75575 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRCPO75575 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRCPO75575 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRCPO75575 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRCPO75575 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRCPO75575 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRCPO75575 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRCPO75575 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRCPO75575 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRCPO75575 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRCPO75575 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRCPO75575 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRCPO75575 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRCPO75575 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRCPO75575 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRCPO75575 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRCPO75575 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRCPO75575 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRCPO75575 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRCPO75575 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRCPO75575 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRCPO75575 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRCPO75575 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRCPO75575 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRCPO75575 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRCPO75575 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRCPO75575 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRCPO75575 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRCPO75575 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRCPO75575 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRCPO75575 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRCPO75575 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRCPO75575 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRCPO75575 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRCPO75575 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRCPO75575 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRCPO75575 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRCPO75575 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRCPO75575 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRCPO75575 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRCPO75575 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRCPO75575 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRCPO75575 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRCPO75575 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRCPO75575 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRCPO75575 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRCPO75575 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRCPO75575 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRCPO75575 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRCPO75575 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRCPO75575 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRCPO75575 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRCPO75575 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRCPO75575 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRCPO75575 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRCPO75575 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRCPO75575 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRCPO75575 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRCPO75575 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRCPO75575 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRCPO75575 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRCPO75575 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRCPO75575 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRCPO75575 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRCPO75575 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRCPO75575 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRCPO75575 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRCPO75575 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRCPO75575 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRCPO75575 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms