Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BANF1O75531 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BANF1O75531 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BANF1O75531 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BANF1O75531 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BANF1O75531 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BANF1O75531 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BANF1O75531 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BANF1O75531 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BANF1O75531 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BANF1O75531 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BANF1O75531 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BANF1O75531 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BANF1O75531 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BANF1O75531 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BANF1O75531 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BANF1O75531 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BANF1O75531 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BANF1O75531 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BANF1O75531 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BANF1O75531 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BANF1O75531 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BANF1O75531 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BANF1O75531 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BANF1O75531 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BANF1O75531 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BANF1O75531 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BANF1O75531 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BANF1O75531 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BANF1O75531 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BANF1O75531 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BANF1O75531 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BANF1O75531 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BANF1O75531 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BANF1O75531 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BANF1O75531 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BANF1O75531 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BANF1O75531 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BANF1O75531 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BANF1O75531 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BANF1O75531 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BANF1O75531 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BANF1O75531 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BANF1O75531 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BANF1O75531 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BANF1O75531 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BANF1O75531 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BANF1O75531 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BANF1O75531 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BANF1O75531 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BANF1O75531 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BANF1O75531 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BANF1O75531 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BANF1O75531 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BANF1O75531 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BANF1O75531 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BANF1O75531 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BANF1O75531 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BANF1O75531 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BANF1O75531 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BANF1O75531 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BANF1O75531 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BANF1O75531 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BANF1O75531 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BANF1O75531 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BANF1O75531 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BANF1O75531 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BANF1O75531 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BANF1O75531 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BANF1O75531 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BANF1O75531 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BANF1O75531 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BANF1O75531 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BANF1O75531 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BANF1O75531 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BANF1O75531 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BANF1O75531 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BANF1O75531 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BANF1O75531 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BANF1O75531 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BANF1O75531 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BANF1O75531 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BANF1O75531 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BANF1O75531 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BANF1O75531 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BANF1O75531 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BANF1O75531 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BANF1O75531 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BANF1O75531 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BANF1O75531 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BANF1O75531 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BANF1O75531 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BANF1O75531 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BANF1O75531 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BANF1O75531 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BANF1O75531 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BANF1O75531 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BANF1O75531 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BANF1O75531 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BANF1O75531 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms