Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VAMP4O75379 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VAMP4O75379 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
VAMP4O75379 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
VAMP4O75379 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
VAMP4O75379 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VAMP4O75379 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms