Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2O75044 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP2O75044 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRGAP2O75044 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms