Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN2BO60939 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN2BO60939 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms