Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUTAO60888 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUTAO60888 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUTAO60888 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUTAO60888 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUTAO60888 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUTAO60888 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUTAO60888 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUTAO60888 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUTAO60888 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUTAO60888 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUTAO60888 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUTAO60888 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUTAO60888 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUTAO60888 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUTAO60888 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUTAO60888 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUTAO60888 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUTAO60888 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUTAO60888 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUTAO60888 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUTAO60888 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUTAO60888 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUTAO60888 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUTAO60888 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUTAO60888 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUTAO60888 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUTAO60888 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUTAO60888 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUTAO60888 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUTAO60888 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUTAO60888 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUTAO60888 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUTAO60888 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUTAO60888 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUTAO60888 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUTAO60888 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CUTAO60888 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUTAO60888 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUTAO60888 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUTAO60888 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUTAO60888 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUTAO60888 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUTAO60888 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUTAO60888 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUTAO60888 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUTAO60888 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUTAO60888 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUTAO60888 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUTAO60888 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUTAO60888 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CUTAO60888 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUTAO60888 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUTAO60888 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUTAO60888 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUTAO60888 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUTAO60888 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUTAO60888 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUTAO60888 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUTAO60888 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUTAO60888 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUTAO60888 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CUTAO60888 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUTAO60888 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUTAO60888 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUTAO60888 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUTAO60888 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUTAO60888 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUTAO60888 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUTAO60888 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CUTAO60888 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUTAO60888 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUTAO60888 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUTAO60888 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUTAO60888 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUTAO60888 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUTAO60888 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUTAO60888 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUTAO60888 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUTAO60888 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUTAO60888 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUTAO60888 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUTAO60888 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUTAO60888 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CUTAO60888 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CUTAO60888 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CUTAO60888 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CUTAO60888 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CUTAO60888 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CUTAO60888 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUTAO60888 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUTAO60888 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUTAO60888 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUTAO60888 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUTAO60888 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUTAO60888 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUTAO60888 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUTAO60888 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUTAO60888 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUTAO60888 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms