Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF10O60809 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF10O60809 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms