Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3BP5O60239 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5O60239 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
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