Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXTL3O43909 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL3O43909 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms