Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CREB3O43889 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CREB3O43889 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3O43889 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3O43889 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3O43889 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3O43889 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3O43889 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3O43889 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3O43889 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3O43889 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3O43889 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3O43889 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3O43889 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3O43889 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3O43889 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3O43889 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3O43889 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3O43889 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3O43889 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3O43889 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3O43889 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3O43889 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3O43889 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3O43889 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3O43889 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3O43889 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3O43889 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3O43889 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3O43889 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3O43889 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3O43889 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3O43889 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3O43889 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3O43889 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3O43889 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3O43889 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3O43889 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3O43889 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3O43889 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3O43889 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3O43889 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3O43889 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3O43889 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3O43889 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3O43889 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3O43889 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3O43889 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3O43889 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3O43889 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3O43889 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3O43889 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3O43889 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB3O43889 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3O43889 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3O43889 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3O43889 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3O43889 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3O43889 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3O43889 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3O43889 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3O43889 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3O43889 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3O43889 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3O43889 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3O43889 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3O43889 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3O43889 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3O43889 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3O43889 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3O43889 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3O43889 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3O43889 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3O43889 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3O43889 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3O43889 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3O43889 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3O43889 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3O43889 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3O43889 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3O43889 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3O43889 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3O43889 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3O43889 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms