Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR3O43761 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR3O43761 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms