Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR2O43760 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms