Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51CO43502 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms