Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF3O43395 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms