Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATMINO43313 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATMINO43313 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATMINO43313 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATMINO43313 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATMINO43313 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATMINO43313 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATMINO43313 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATMINO43313 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATMINO43313 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATMINO43313 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATMINO43313 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATMINO43313 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATMINO43313 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATMINO43313 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATMINO43313 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATMINO43313 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATMINO43313 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATMINO43313 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATMINO43313 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATMINO43313 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATMINO43313 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATMINO43313 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATMINO43313 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATMINO43313 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATMINO43313 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATMINO43313 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATMINO43313 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATMINO43313 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATMINO43313 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATMINO43313 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATMINO43313 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATMINO43313 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATMINO43313 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATMINO43313 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATMINO43313 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATMINO43313 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATMINO43313 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATMINO43313 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATMINO43313 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATMINO43313 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATMINO43313 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATMINO43313 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATMINO43313 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATMINO43313 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATMINO43313 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATMINO43313 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATMINO43313 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATMINO43313 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMINO43313 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMINO43313 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMINO43313 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMINO43313 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMINO43313 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMINO43313 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMINO43313 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMINO43313 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMINO43313 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMINO43313 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMINO43313 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMINO43313 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMINO43313 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMINO43313 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATMINO43313 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATMINO43313 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATMINO43313 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATMINO43313 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATMINO43313 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATMINO43313 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATMINO43313 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATMINO43313 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATMINO43313 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATMINO43313 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATMINO43313 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATMINO43313 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATMINO43313 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATMINO43313 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATMINO43313 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATMINO43313 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATMINO43313 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATMINO43313 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATMINO43313 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATMINO43313 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMINO43313 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMINO43313 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMINO43313 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMINO43313 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMINO43313 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMINO43313 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMINO43313 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMINO43313 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMINO43313 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMINO43313 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMINO43313 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMINO43313 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMINO43313 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATMINO43313 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATMINO43313 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATMINO43313 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATMINO43313 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms