Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPAA1O43292 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms