Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
POLR2DO15514 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2DO15514 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms