Protein–RNA interactions for Protein: O15484

CAPN5, Calpain-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN5O15484 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN5O15484 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN5O15484 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN5O15484 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms