Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN6O15212 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms