Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB6O15197 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB6O15197 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB6O15197 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms