Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD28O15084 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD28O15084 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms