Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1AO15047 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1AO15047 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1AO15047 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1AO15047 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETD1AO15047 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SETD1AO15047 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SETD1AO15047 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SETD1AO15047 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1AO15047 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1AO15047 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SETD1AO15047 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms