Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAMP3O14828 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCAMP3O14828 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAMP3O14828 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms