Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.81e-9■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 AGPAT2-203ENST00000470861 720 ntTSL 222.68■■□□□ 1.225e-14■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.635e-14■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.555e-14■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 PITX1-206ENST00000507253 587 ntTSL 324.32■■□□□ 1.485e-12■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 PITX1-202ENST00000502676 666 ntTSL 324.01■■□□□ 1.435e-12■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-12■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.065e-12■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.191e-31■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 ZDHHC7-202ENST00000344861 2727 ntTSL 1 (best)18.02■□□□□ 0.481e-31■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-31■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 SH3BP1-203ENST00000451997 3123 ntTSL 213.74□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.722e-8■■■■■ 44.4
DDX3XO00571 ATP13A3-205ENST00000457986 490 ntTSL 324.92■■□□□ 1.588e-18■■■■■ 44.3
DDX3XO00571 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.741e-10■■■■■ 44.3
DDX3XO00571 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.621e-10■■■■■ 44.3
DDX3XO00571 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.381e-10■■■■■ 44.3
DDX3XO00571 TEX264-210ENST00000457927 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.75■□□□□ 0.919e-17■■■■■ 44.3
DDX3XO00571 TEX264-208ENST00000444233 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.66■□□□□ 0.589e-17■■■■■ 44.3
DDX3XO00571 TEX264-214ENST00000493444 554 ntTSL 39.7□□□□□ -0.869e-17■■■■■ 44.3
DDX3XO00571 GRINA-206ENST00000530898 558 ntTSL 216.09■□□□□ 0.173e-24■■■■■ 44.2
DDX3XO00571 LHFPL2-204ENST00000510949 534 ntTSL 515.33■□□□□ 0.049e-9■■■■■ 44.2
DDX3XO00571 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 316.6■□□□□ 0.251e-323■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-323■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.711e-323■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.831e-323■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.161e-323■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.451e-323■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 PQLC1-210ENST00000589452 704 ntTSL 529.32■■■□□ 2.287e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.287e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.27e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.147e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.127e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.97e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 PQLC1-213ENST00000591964 856 ntTSL 325.79■■□□□ 1.727e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 PQLC1-214ENST00000593030 764 ntTSL 525.29■■□□□ 1.647e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 MTMR4-209ENST00000583656 810 ntTSL 324.78■■□□□ 1.567e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 MTMR4-206ENST00000582390 1281 ntTSL 524.78■■□□□ 1.567e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.182e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 PQLC1-206ENST00000474967 2319 ntTSL 521.69■■□□□ 1.067e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.947e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 BCAR1-213ENST00000563323 558 ntTSL 320.82■□□□□ 0.927e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 ARHGEF1-221ENST00000600387 2272 ntTSL 320.24■□□□□ 0.832e-11■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 NEIL2-206ENST00000528113 554 ntTSL 419.77■□□□□ 0.767e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.751e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.627e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 CREB3-202ENST00000486056 1496 ntTSL 218.73■□□□□ 0.592e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.597e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.527e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.487e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.457e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.447e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 CCDC116-202ENST00000425975 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 417.49■□□□□ 0.397e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.352e-11■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 CPVL-212ENST00000488891 696 ntTSL 516.95■□□□□ 0.31e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 CPVL-205ENST00000437527 524 ntTSL 416.82■□□□□ 0.287e-12■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.277e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.277e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.227e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.27e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.27e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 SLC9A3R2-209ENST00000567504 578 ntTSL 316.27■□□□□ 0.27e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.177e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-11■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.137e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 ARHGEF1-214ENST00000596957 570 ntTSL 315.72■□□□□ 0.112e-11■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 EFCAB11-207ENST00000555608 644 ntTSL 215.16■□□□□ 0.027e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 EFCAB11-212ENST00000556639 2326 ntTSL 514.89□□□□□ -0.037e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 GBA-209ENST00000473570 862 ntTSL 514.85□□□□□ -0.037e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.121e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.142e-11■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.187e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 CPVL-201ENST00000265394 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 MTMR4-203ENST00000579921 425 ntTSL 513.42□□□□□ -0.267e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 GBA-213ENST00000493842 1020 ntTSL 513.41□□□□□ -0.267e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 HACL1-204ENST00000421993 861 ntTSL 313.41□□□□□ -0.261e-18■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 ZNF473-207ENST00000598809 605 ntTSL 413.38□□□□□ -0.271e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.297e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.317e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 GBA-201ENST00000327247 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.347e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 CPVL-209ENST00000455544 571 ntTSL 412.78□□□□□ -0.361e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 ZNF473-204ENST00000594968 475 ntTSL 312.75□□□□□ -0.371e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 GBA-204ENST00000428024 1817 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.397e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 MXD4-204ENST00000513380 624 ntTSL 512.6□□□□□ -0.397e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 ARHGEF1-220ENST00000600274 3439 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.42e-11■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 HACL1-202ENST00000383779 1771 ntTSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.421e-18■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 HACL1-201ENST00000321169 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.451e-18■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 SRP14-AS1-201ENST00000504245 2317 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.477e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 EFCAB11-201ENST00000316738 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.57e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 HACL1-209ENST00000457447 1721 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.51e-18■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 HACL1-212ENST00000472857 558 ntTSL 211.67□□□□□ -0.541e-18■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 ZNF473-201ENST00000270617 4688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 HACL1-210ENST00000460907 565 ntTSL 211.19□□□□□ -0.621e-18■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 HACL1-213ENST00000628377 2214 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.621e-18■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 CPVL-203ENST00000409850 2213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.631e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 HACL1-203ENST00000414979 569 ntTSL 411.11□□□□□ -0.631e-18■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 HACL1-207ENST00000451445 1734 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.641e-18■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 PQLC1-207ENST00000478144 409 ntTSL 310.99□□□□□ -0.657e-10■■■■■ 44.1
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