Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CDO00329 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CDO00329 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CDO00329 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms