Protein–RNA interactions for Protein: O00299

CLIC1, Chloride intracellular channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC1O00299 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIC1O00299 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLIC1O00299 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLIC1O00299 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLIC1O00299 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLIC1O00299 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIC1O00299 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIC1O00299 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIC1O00299 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIC1O00299 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIC1O00299 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIC1O00299 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIC1O00299 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIC1O00299 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIC1O00299 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIC1O00299 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIC1O00299 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIC1O00299 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLIC1O00299 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIC1O00299 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIC1O00299 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIC1O00299 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLIC1O00299 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIC1O00299 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIC1O00299 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIC1O00299 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIC1O00299 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIC1O00299 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIC1O00299 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLIC1O00299 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLIC1O00299 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIC1O00299 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIC1O00299 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLIC1O00299 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLIC1O00299 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms