Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD12O00232 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD12O00232 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD12O00232 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms