Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
H7C1W4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
H7C1W4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
H7C1W4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
H7C1W4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
H7C1W4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
H7C1W4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
H7C1W4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
H7C1W4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
H7C1W4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1W4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1W4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1W4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1W4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1W4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1W4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1W4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1W4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
H7C1W4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
H7C1W4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
H7C1W4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
H7C1W4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
H7C1W4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
H7C1W4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
H7C1W4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
H7C1W4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
H7C1W4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
H7C1W4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
H7C1W4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
H7C1W4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
H7C1W4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H7C1W4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
H7C1W4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H7C1W4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H7C1W4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H7C1W4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H7C1W4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H7C1W4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
H7C1W4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
H7C1W4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
H7C1W4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
H7C1W4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
H7C1W4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
H7C1W4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
H7C1W4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
H7C1W4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
H7C1W4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
H7C1W4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
H7C1W4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
H7C1W4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
H7C1W4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
H7C1W4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
H7C1W4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
H7C1W4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
H7C1W4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
H7C1W4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
H7C1W4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
H7C1W4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1W4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
H7C1W4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
H7C1W4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
H7C1W4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
H7C1W4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
H7C1W4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
H7C1W4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1W4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1W4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1W4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1W4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1W4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1W4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1W4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1W4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1W4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1W4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1W4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
H7C1W4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
H7C1W4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
H7C1W4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
H7C1W4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
H7C1W4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
H7C1W4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
H7C1W4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
H7C1W4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
H7C1W4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
H7C1W4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms