Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMX2-CTNND1H3BSU7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMX2-CTNND1H3BSU7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms