Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
F8VP50 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
F8VP50 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F8VP50 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F8VP50 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F8VP50 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
F8VP50 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F8VP50 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
F8VP50 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F8VP50 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F8VP50 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F8VP50 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
F8VP50 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
F8VP50 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
F8VP50 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
F8VP50 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
F8VP50 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
F8VP50 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F8VP50 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F8VP50 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F8VP50 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F8VP50 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F8VP50 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
F8VP50 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
F8VP50 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
F8VP50 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F8VP50 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F8VP50 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F8VP50 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F8VP50 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F8VP50 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F8VP50 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F8VP50 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F8VP50 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F8VP50 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F8VP50 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F8VP50 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
F8VP50 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
F8VP50 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F8VP50 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F8VP50 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
F8VP50 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F8VP50 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F8VP50 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8VP50 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8VP50 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8VP50 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8VP50 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8VP50 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8VP50 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8VP50 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8VP50 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8VP50 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F8VP50 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8VP50 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8VP50 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8VP50 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8VP50 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8VP50 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8VP50 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8VP50 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F8VP50 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8VP50 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8VP50 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8VP50 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8VP50 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8VP50 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8VP50 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F8VP50 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F8VP50 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8VP50 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8VP50 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms