Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPB6E9PJ23 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPIPB6E9PJ23 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms