Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK3BL2E5RIL1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK3BL2E5RIL1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK3BL2E5RIL1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK3BL2E5RIL1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK3BL2E5RIL1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK3BL2E5RIL1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK3BL2E5RIL1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms