Protein–RNA interactions for Protein: B7U540

KCNJ18, Inward rectifier potassium channel 18, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ18B7U540 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNJ18B7U540 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNJ18B7U540 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNJ18B7U540 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms