Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B4DXG7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DXG7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DXG7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DXG7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DXG7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DXG7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DXG7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DXG7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DXG7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DXG7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
B4DXG7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
B4DXG7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
B4DXG7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
B4DXG7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
B4DXG7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
B4DXG7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
B4DXG7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
B4DXG7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
B4DXG7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
B4DXG7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
B4DXG7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
B4DXG7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
B4DXG7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
B4DXG7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DXG7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DXG7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DXG7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DXG7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DXG7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DXG7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DXG7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DXG7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DXG7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
B4DXG7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
B4DXG7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
B4DXG7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
B4DXG7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
B4DXG7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
B4DXG7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
B4DXG7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
B4DXG7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
B4DXG7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
B4DXG7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
B4DXG7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
B4DXG7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
B4DXG7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
B4DXG7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
B4DXG7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
B4DXG7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
B4DXG7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
B4DXG7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
B4DXG7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
B4DXG7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
B4DXG7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
B4DXG7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
B4DXG7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
B4DXG7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
B4DXG7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
B4DXG7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
B4DXG7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
B4DXG7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
B4DXG7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
B4DXG7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
B4DXG7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
B4DXG7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
B4DXG7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
B4DXG7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
B4DXG7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
B4DXG7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
B4DXG7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
B4DXG7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
B4DXG7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
B4DXG7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
B4DXG7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
B4DXG7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
B4DXG7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
B4DXG7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
B4DXG7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
B4DXG7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
B4DXG7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
B4DXG7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms