Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM233B4DJY2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM233B4DJY2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM233B4DJY2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms