Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP27XA6NNY8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP27XA6NNY8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
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