Protein–RNA interactions for Protein: A6NJY4

Putative transmembrane protein LOC100289255, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJY4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NJY4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NJY4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NJY4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NJY4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NJY4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NJY4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NJY4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NJY4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NJY4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NJY4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NJY4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NJY4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NJY4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NJY4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NJY4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NJY4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NJY4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NJY4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NJY4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NJY4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NJY4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NJY4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NJY4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NJY4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NJY4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NJY4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NJY4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NJY4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NJY4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NJY4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NJY4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NJY4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NJY4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NJY4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms