Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms