Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC160A6NGH7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC160A6NGH7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC160A6NGH7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms