Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3AA6NCI4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
VWA3AA6NCI4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms