Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPED1A4D0V7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CPED1A4D0V7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPED1A4D0V7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms